Por la información que ha facilitado aquí, se le denegó el embarque por error. Su visado estadounidense era suficiente para realizar el tránsito:
Information as of 23AUG15 / 0855 UTC
National Syria (SY) /Residence Jordan (JO)
Embarkation Jordan (JO) /Transit Germany (DE)
Destination USA (US)
ALSO CHECK DESTINATION INFORMATION BELOW
Germany (DE)
TWOV (Transit Without Visa):
Visa required, except for Nationals of Syria holding onward
through Cologne/Bonn (CGN),
Frankfurt (FRA), Munich (MUC), Hamburg (HAM), Dusseldorf (DUS)
or Berlin Tegel (TXL) **AND** meeting one of the following
conditions:
- holding a valid visa issued by Bulgaria, Canada, Croatia,
Cyprus, Ireland (Rep.), Japan, Romania, USA or United
Kingdom;
- WARNING: TWOV is not possible when arriving from a
non-Schengen Member State AND departing to a Schengen Member
Creo que deberías presentar una queja a Lufthansa (por el mal servicio de atención al cliente) y pedirles que te repongan el billete para viajar cuando te convenga.
Cíñete a los hechos, di lo que ha pasado, aporta una fotocopia del visado y proporciona una copia del correo electrónico de la embajada diciendo que todo está bien. No hay necesidad de emociones. Yo no hablaría de la indemnización en este momento, pero es posible que tengas derecho a ella. Es mejor buscarla más adelante.
En el futuro, si esto ocurre, pediría hablar con el jefe de estación de Lufthansa (que es un empleado de Lufthansa) en lugar de aceptar simplemente lo que dice la persona que factura. En las estaciones, los empleados de facturación suelen ser contratistas locales que no conocen las normas de la aerolínea y a menudo están mal formados.