¿Cuáles son las consecuencias de sobrepasar la zona Schengen durante 28 días en un periodo de 90 días con un visado válido para los 3 meses siguientes?

No existe una normativa de ámbito Schengen sobre cómo reaccionar ante las infracciones de visado y los rebasamientos de estancia. Cada Estado miembro es libre de establecer sus propias sanciones y reacciones. Los excesos de estancia suelen resolverse con una multa, pero en casos graves, también se puede prohibir la entrada a Schengen durante un periodo de tiempo. No encuentro las tarifas actuales, pero en 2011 Suiza impuso multas de entre 200 y 650 CHF por exceso de estancia.

En este caso, lo más probable es que el funcionario de inmigración suizo no se haya percatado de su exceso de estancia. Cuando solicite un visado nacional, debe suponer que el consulado hará un examen más exhaustivo de su historial de viajes, especialmente al espacio Schengen, y que el exceso de estancia se notará y muy probablemente causará problemas.

Escribe en un comentario:

Está absolutamente claro que mi exceso de estancia en 28 días está fijado en los datos base de datos ...

Afortunadamente, este no es el caso. No existe una base de datos de entradas y salidas en todo el territorio Schengen y, aunque algunos países tienen sus propias bases de datos, los datos no son completos y no son adecuados para seguir su historial de viajes. Dado que actualmente el único rastro de su estancia excesiva son los sellos de entrada y salida en su pasaporte, éste podría ser uno de los pocos casos en los que "perder" su antiguo pasaporte y solicitar uno nuevo resolvería su problema.