¿Cuáles son los pros y los contras de reservar un vuelo a través de la aerolínea principal frente a reservar el mismo vuelo a través de una aerolínea asociada?

Esto es un poco complicado, porque potencialmente hay hasta tres portadores involucrados (en realidad puede haber uno más pero no voy a entrar en eso).

1. El "portador operativo". Esta es la aerolínea que realmente opera el vuelo. A veces usamos la palabra "metal", por ejemplo, este es un vuelo de BA metal si tiene el logo de BA impreso en el exterior y gente con uniformes de BA en el interior. (A veces el vuelo es realmente operado por una compañía subsidiaria bajo el control de la aerolínea operadora, pero no nos detengamos en esa complicación).
2. El "portador de marketing". Esta es la compañía que te comercializó el vuelo. Es la compañía que aparece en su itinerario y en su billete. Podría ser la misma que la aerolínea operadora, en cuyo caso podemos referirnos al número de vuelo "primo". Sin embargo, si es una compañía diferente, entonces es un código compartido. En su ejemplo, American Airlines es la aerolínea de marketing.
3. El "portador de billetes". Este es el portador que realmente te da un billete. Normalmente este será uno de los portadores de marketing en su itinerario, normalmente el primero o el que comercializa el tramo más largo del viaje. Es el transportista responsable de recoger el pago y distribuirlo a los otros transportistas del billete. A veces utilizamos la expresión "portador validador", que se debe a que este portador es responsable de validar que el itinerario sea correcto y esté debidamente pagado. También podemos utilizar la expresión "transportista validador", porque en los viejos tiempos de los billetes de papel, se utilizaba una gran placa metálica antigua con el nombre y el número de código de la aerolínea para sellar los billetes de papel carbón. Sólo hay un portador de billetes para el billete, pero puede haber muchos portadores comerciales y operativos diferentes mezclados.

Como se puede ver, si compras el billete en AA.com, incluso para un vuelo de BA metal, entonces el billete es "propiedad" de AA, porque AA es la compañía de billetes. El billete es un documento financiero con valor monetario (aunque ahora todo es electrónico). BA no puede tocar un billete no volado emitido por AA, incluso si se trata de sus propios vuelos*.

Sin embargo, una vez que el billete cae bajo el "control del aeropuerto", lo que hace 24 horas antes de la salida, entonces el transportista operativo tiene cierta capacidad para modificar el billete, pero es difícil y muchos de los empleados de BA no están capacitados para utilizar el sistema de AA. En tu lugar probablemente habría insistido en que BA arreglara su propio desorden en lugar de ir a la terminal de AA, pero eso es cuestión de experiencia.

Como sospechas, BA puede tratar a los titulares de sus propios boletos mejor que a los de un código compartido. En realidad, dudo mucho que BA haga esto con los boletos de AA, porque AA y BA son socios muy cercanos en un acuerdo especial de cooperación. Creo que tuviste un poco de mala suerte. Sin embargo, si estabas en un billete de Lufthansa con un corto vuelo doméstico de BA en el Reino Unido, espero que te dijeran que fueras a buscar a Lufthansa.

La razón principal para reservar un código compartido es: a) el precio y b) los beneficios de los viajeros frecuentes. Por ejemplo, trato de reservar tantos vuelos como sea posible con los números de BA, porque obtengo más puntos por esto que los vuelos de AA.

*En realidad AA y BA tienen una autoridad especial para manipular los billetes del otro, pero esto es inusual en el mundo de las aerolíneas: y no lo harán a menos que seas comercialmente importante para ellos.

Unas cuantas experiencias personales más:

1. Las normas sobre el estatus de viajero frecuente se han vuelto muy complicadas y se ven afectadas por esto. Por ejemplo: United requiere no sólo millas voladas sino también dólares gastados. Comprar el mismo vuelo en United acumulará dólares, comprar en una aerolínea asociada no lo hará, a menos que sea un verdadero metal de United.
2. Reservar de nuevo puede ser una molestia. Reservamos un combo Delta-KLM-Al Italia en Delta. Estos son todos los socios de Sky Team. La primera etapa se retrasó, así que tuvieron que hacer una nueva reserva con Air France a través de París. Delta estropeó totalmente la reserva y casi perdemos el vuelo de vuelta ya que Al Italia necesitaba volver a emitir los billetes

Los precios suelen ser muy similares, así que si el estatus no importa, yo iría con la aerolínea que pueda tener el servicio de atención al cliente más competente.

En mi experiencia, reservar con la aerolínea principal (la "voladora") lleva a la menos cantidad de molestias.

Hablo mayormente en vuelos asiáticos/europeos, y no desde/hacia los vuelos de EE.UU. para los que he volado poco (irónicamente, fue con BA/AA, pero el billete se reservó desde BA); y el segundo desde el Golfo/AA pero reservado en el Golfo.

Por eso recomiendo reservar con la compañía aérea:

1. El transportista aéreo tendrá la mayor capacidad en sus respectivos centros/terminales; a veces esto afecta a los beneficios que se obtienen - por ejemplo, puede ser capaz de utilizar la sala de espera del propio transportista aéreo, pero tendrá que utilizar una sala de espera compartida o de terceros si no está en el billete principal. Sin embargo, si vuela con un producto de primera calidad (como business/first), puede haber excepciones para usted.

2. Manejo de equipaje. Una vez más, esto va hacia las operaciones y requisitos del centro. En mi vuelo de regreso, que era AA/Gulf, mi equipaje se perdió pero como estaba etiquetado en American - Gulf Air tuvo dificultades para intentar averiguar dónde estaba (hubo tres cambios de avión en el itinerario) ya que AA no tenía oficinas en Bahrein.

3. Ventajas del kilometraje - como ya se ha mencionado, la aerolínea que le quitó su dinero le dará las mayores ventajas en su condición de viajero frecuente. Generalmente hay dos tipos de millas que puedes obtener, una por comprar cosas de tu pareja (como tarjetas de crédito que acumulan millas) y luego por comprar boletos. Normalmente, la mayoría de las ventajas (por ejemplo, la validez del estatus) proviene de la compra de los billetes y no de la transferencia de millas. Para las aerolíneas que he volado, todas tienen esta distinción (Emirates es una de las más grandes).