Creo que puedo responder a algunas de sus preguntas.
Quería que utilizara el pasaporte tailandés para el viaje a Tailandia en breve y no el de Nueva Zelanda. La idea era que mostrara su pasaporte de Nueva Zelanda cuando volviéramos a la aerolínea, pero que no tuviera el sello de salida de Nueva Zelanda.
Así que tres cosas diferentes: la aerolínea, la inmigración tailandesa y la inmigración neozelandesa.
La compañía aérea
Puedes mostrar a la aerolínea ambos pasaportes (puede que te lo pidan al salir de Tailandia cuando vean que no hay sellos de entrada en tu pasaporte de NZ; también querrán ver el pasaporte de NZ porque no hay visado de NZ en el pasaporte tailandés), el pasaporte tailandés les mostrará que tu pareja (la que tiene ambos pasaportes) no tendrá problemas en la inmigración tailandesa (en ambos sentidos, entrando y saliendo de Tailandia, porque es un ciudadano). El pasaporte de Nueva Zelanda mostrará lo mismo para su entrada y salida de Nueva Zelanda.
Inmigración tailandesa
Al pasar por inmigración tailandesa, tu pareja puede optar por ir con su pasaporte tailandés (según mi experiencia, es lo más fácil, y además si se queda más tiempo no necesitará visado), sólo tienes que asegurarte de que es el mismo (o un nuevo pasaporte tailandés) a la entrada que a la salida. Los ciudadanos tailandeses (con sus pasaportes tailandeses) pueden pasar la frontera utilizando una máquina automática (suponiendo que su pasaporte tenga datos biométricos, probablemente los tenga, puedes comprobar si tiene el signo biométrico ; también suponiendo que salgan por un aeropuerto con esas máquinas, las fronteras terrestres no las tienen, que yo sepa).
Si tienen un pasaporte neozelandés también podrían utilizarlo (en Tailandia), pero no tiene ningún sentido (por lo que veo) hacerlo.
Si tu pareja se une a la cola de extranjeros, su pasaporte de NZ será revisado por un funcionario de inmigración tailandés (como cualquier otro ciudadano de NZ). Si entraron con su pasaporte tailandés y salen con su pasaporte neozelandés, tendrán un problema por la falta de sellos (parecerá que entraron ilegalmente en el país), así que no lo hagas.
Inmigración en Nueva Zelanda
Al igual que tú, tendrán que identificarse con su pasaporte neozelandés para entrar (y salir) de Nueva Zelanda.
O como es electrónico, ¿los pasaportes sólo se escanean para los tailandeses en el punto de entrada por una máquina, como aquí para los ciudadanos de Nueva Zelanda y cuáles serían los problemas probables en la salida.
Esto depende, si pasas por la máquina, no es revisado por un funcionario de inmigración. Si las máquinas están averiadas (¿podría ser?), acabas en una cola con un funcionario en lugar de una máquina o no hay máquinas en tu punto de entrada/salida, entonces te enfrentarás a un funcionario de inmigración.
Ahora tiene una propiedad en Tailandia que no quiero poner en peligro. ¿Sería un problema para él viajar con su pasaporte de Nueva Zelanda?
Que yo sepa, su propiedad no tiene nada que ver con su pasaporte (muchos tailandeses no tienen pasaporte, pero se identifican con un documento nacional de identidad). Probablemente esté bajo la administración del Departamento de Tierras A la que su pareja se identificará utilizando su documento de identidad tailandés (en lugar de su pasaporte). Si no tiene un documento de identidad (válido), deberá conseguirlo en la oficina municipal donde esté empadronado.
Tener ese documento de identidad es muy importante, es lo que usarían si les para la policía o tienen que identificarse en cualquier otro lugar de Tailandia (después de pasar la frontera). Como regla general, cuando hay que mostrar el pasaporte para demostrar que se está en el país legalmente, ellos muestran su tarjeta de identificación (de la misma manera que probablemente no siempre lleves tu pasaporte en tu propio país de NZ).
No hay sellos en los pasaportes tailandeses
También veo que te preocupa la falta de sellos en los pasaportes tailandeses al entrar en Tailandia. Esto realmente no es un problema. Las incoherencias en los sellos por parte de la inmigración tailandesa son habituales, ya que no te pondrán sellos al entrar o salir por una máquina.
La falta de sellos de otros países también es habitual, ya que muchos tailandeses viajan al extranjero utilizando un segundo pasaporte (extranjero).