¿Paradas en los servicios Shinkansen?

Como señala macraf en su respuesta En la actualidad, todos los servicios de Shinkansen al norte de Morioka (Hayabusa y Hayate) sólo tienen asientos reservados. Entre Morioka y Tokio, puede tomar un tren Yamabiko, más lento, que tendrá asientos no reservados.

Si quiere salir por las puertas de la estación intermedia

Esta es la definición JR de "escala" (途中下車). Básicamente, los billetes de tarifa básica permiten hacer escalas (a menos que sea para un viaje muy corto dentro de una zona urbana) pero las entradas exprés son limitadas (ya sea para plazas reservadas o no reservadas) no lo hagas.

Por lo tanto, en este caso la mejor estrategia es comprar un billete de tarifa básica de Hakodate a Tokio y dos billetes exprés limitados por separado. Cuando salga de la estación intermedia, se le devolverá el billete de tarifa básica y podrá utilizarlo de nuevo para volver a entrar. Además, como se trata de un viaje muy largo, su billete de tarifa básica será válido durante varios días (el periodo de validez estará impreso en el billete), por lo que podría incluso hacer varias escalas nocturnas.

Si no sale por las puertas de la estación intermedia

Si utiliza asientos reservados, lo anterior también se aplica porque los billetes de asiento reservado sólo se emiten para un tren concreto en un día concreto, y no son válidos en ningún otro tren.

Si utiliza asientos no reservados, puede bajar de un tren y subir a otro con un único billete exprés limitado, ya que los billetes de asientos no reservados son válidos en todos los trenes de un día determinado. (Por ejemplo, si compro un billete de asiento no reservado de Morioka a Tokio válido hoy, puedo parar en Sendai para tomar un plato de udon y de nuevo en Koriyama para comprar el excelente senbei que venden allí).

Así que en tu caso, para tener la máxima flexibilidad de escalas puedes comprar un billete de asiento reservado de Hakodate a Morioka (ya que los trenes de este tramo no tienen asientos no reservados), y luego un billete de asiento no reservado de Morioka a Tokio (y puedes hacer todas las escalas que quieras en este tramo siempre que no salgas de las puertas de billetes).

1. Si compra billetes separados para el viaje:

   Con los asientos reservados es bastante obvio: hay que comprar dos billetes para dos tramos del viaje. Con los billetes del Shinkansen express será más caro que comprar un billete sencillo de Tokio a Hakodate.

   Ejemplo con Tohoku Shinkansen:

   Tokio - Shin Aomori: 17.150 yenes
   Tokio - Sendai - Shin Aomori: 11.000 + 11.010 yenes

   Con los asientos no reservados puede abandonar el tren y continuar su viaje en otro tren, pero no puede salir de la zona del Shinkansen de la estación. Si lo hace, invalidará el billete exprés (si cambia a los trenes regulares de JR llamados " zairaisen ") o invalidará todo el billete (tarifa básica + billete exprés) si sale de la estación (es decir, de la zona de billetes).

   Si su billete de tarifa básica se emitió para una distancia superior a 100 km, puede solicitar el reembolso de la parte no utilizada de la tarifa básica (pero tendría que pedirlo en una puerta con personal antes de abandonar la zona de billetes).

   Tenga en cuenta que los trenes más rápidos del Shinkansen de Tohoku y probablemente del Shinkansen de Hokkaido ofrecen todos los asientos reservados.

   Básicamente, tiene poco valor salir del tren y quedarse dentro de la zona del Shinkansen de la estación. Se puede comprar una caja de comida (bento) o fideos soba baratos en el andén.

2. Si viaja con el JR Pass, entonces depende de usted cómo dividir su viaje.

   Con los asientos no reservados puedes irte cuando quieras, con los asientos reservados tendrás que pedir las reservas correspondientes por adelantado. Aunque técnicamente podrías conseguir una reserva Tokio-Hakodate, salir y conseguir otra reserva, por ejemplo, de Sendai-Hakodate, supongo que JR intenta evitar esto (así como el overbooking y los no-shows) estampando o haciendo anotaciones en el JR Pass.