¿Cómo llegar de Tarapoto a Chachapoyas en Perú?

He estado buscando mucho, y parece que no hay una ruta directa de Tarapoto a Chachapoyas. Tu mejor opción es la que ya leíste.

Toma un taxi local¹ o una minivan hasta Pedro Ruiz (En el enlace encontrarás un lugar donde puedes descansar y ver más del paisaje nativo como cascadas, etc.), es un viaje de aproximadamente 3 horas y cuando llegues tendrás que hacer más de lo mismo, tomar otro transporte local a Chachapoyas.

Te recomiendo que preguntes a la gente de la zona dónde y con qué frecuencia sale este tipo de transporte, de lo contrario ve muy temprano y prueba tu suerte.

Según este sitio web que es uno de los blogs más recientes que he encontrado, hay transporte directo (aun siendo local) pero solo sale 4 veces al día (6am, 8am, 10am y 12pm) pero también menciona a Moviltours (que no pude encontrar) así que no confiaría al 100%, pero es una buena pista.

Consejo personal

Siendo peruano y tomando mucho transporte local, mi consejo sería preguntar en tu hotel o incluso antes en el aeropuerto de Tarapoto, y ellos podrán decirte más al respecto. También puedes buscar agencias de viaje, preguntarles como si fueras a reservar cuál sería tu itinerario, solo para saber qué harían ellos, luego solo dices que lo vas a pensar y utilizas la información que te den.

(¹): Los transportes locales suelen estar alrededor de las calles principales, mercados o la plaza principal de la ciudad, los reconocerás fácilmente porque a menudo están gritando a dónde van.