No hay ningún procedimiento especial ni ningún documento adicional para que los menores crucen la frontera alemana (sí necesitas un pasaporte/documento de identidad y, posiblemente, un visado). Ten en cuenta que si no sales de la zona de tránsito internacional, es probable que no tengas que pasar ningún control de pasaportes y, si eres ciudadano de la UE, no deberían hacerte ninguna pregunta (o, al menos, no deberían hacértela a los adultos).
Aunque esto preocupa más a los niños pequeños que a los adolescentes, los guardias fronterizos (o, de hecho, la policía, si te encuentras en algún tipo de problema o situación inusual) podrían hacerte algunas preguntas para determinar si te has escapado, has sido secuestrado o sustraído de algún modo de la custodia de tus tutores legales sin su autorización.
Por eso, tener alguna carta de tus padres o tutor legal puede ser útil y lo recomiendan muchas fuentes, entre ellas el Ministerio de Asuntos Exteriores alemán . Al menos debería estar en inglés, posiblemente también en alemán, e incluso podría estar notariada (como sugieren @Willeke y el ministerio). Pero nada de esto es estrictamente obligatorio.
Algunos países como Francia exigían antes algún tipo de documento oficial para permitir a los menores salir de su territorio sin sus dos progenitores. Por lo que sé, éste y otros requisitos similares se han suprimido en la mayoría de los países, sobre todo en la UE, y lo que queda son cartas informales del tipo que he descrito antes. Pero compruebe si en su país existe alguna norma de este tipo, ya que es más probable que los guardias fronterizos se preocupen por su salida del territorio que los de un país de tránsito.
Por cierto, las compañías aéreas tienen que comprobar los documentos de viaje de sus pasajeros y asegurarse de que tienen derecho a entrar en su destino y disponen de los visados de tránsito necesarios. No creo que tengan ningún problema con que viajes solo, pero quizá debas consultarlo con ellos.