¿Se puede hacer Berlín y Múnich en un solo fin de semana?

Estuve en Berlín durante cuatro semanas (!) en las vacaciones escolares de verano de 2004 (18 años). No fue nada aburrido durante ese tiempo, aunque debo admitir que pasé algunos días en museos y en Wannsee Tegeler See, así como en el fin de semana de "puertas abiertas" del gobierno federal.

Pero aún así, Berlín tiene suficientes atracciones para llenar por completo su fin de semana - museos, fuentes e iglesias no incluidos. El Checkpoint Charlie, el Muro de Berlín, la torre de televisión y la cúpula del Reichstag, por nombrar algunos. Sin olvidar que estarás en un autobús durante la noche del sábado, cuando todo berlinés cuerdo está disfrutando. Por otro lado, las literas baratas de los albergues en lugares de vida nocturna cuestan a partir de 15 euros por noche.

Múnich también tiene suficientes atracciones para un fin de semana, si no más; pero si el precio es importante, yo no iría allí durante el Oktoberfest, con albergues regulares a partir de 100€ por una sola noche.

Realmente deberías considerar hacer una sola ciudad ahora, y guardar la otra ciudad para tu próxima visita a Alemania.

Si realmente puedes dormir en los autobuses y hay billetes para los autobuses que piensas coger, puedes hacerlo.
Pero la mayoría de las personas estarán destrozadas después de una noche en un autobús, dormirán poco o muy poco y no les irá bien hacerlo más de una noche seguida. Los trenes pueden ser un poco mejores, pero no lo suficiente, y son más caros.
Hay No veo ningún tren nocturno directo de Berlín a Múnich, (aunque puede haber uno en otros días) y su opción más fácil es salir de Berlín después de una cena temprana para llegar a Múnich sobre las 7 de la mañana, o salir un poco más tarde y "cambiar" con una parada de unas horas en medio de la noche.

Tendrá unas cuantas horas, probablemente más dependiendo de la hora de llegada y salida de los autobuses, para ver los principales lugares de interés de las ciudades.

La opción más fácil es hacer una excursión, aunque en este viaje verá más autobuses de los que debería.
La otra opción es caminar, ya sea en un tour o por tu cuenta, pero tienes que hacer tus deberes para ver qué hay que ver en las ciudades.

Creo que no vas a sacar mucho provecho de este viaje, aparte del derecho a presumir.
Si realmente quieres hacerlo, reserva todos los billetes de autobús y/o tren en una sola acción, para no acabar con dos de tres billetes, haciéndolos inútiles. Haz tus deberes, consigue una guía (online) de cada una de las ciudades y léela. O simplemente busca información turística en Internet.
Ya que se encuentra en Múnich durante el festival, considere la posibilidad de reservar en una de las carpas de las cervecerías, ya que entrar a pie parece poco probable, sobre todo porque dispone de poco tiempo.

Si tuvieras un día más te sugeriría volar de Berlín a Múnich, pero como los vuelos se comen mucho más tiempo que el propio viaje, me temo que no ganarás nada sino que perderás un par de horas diurnas para ir y volver del aeropuerto, y no podrás dormir mucho o nada incluso para un vuelo de madrugada. Un vuelo nocturno solucionará eso pero tiene el potencial de dejarte sólo con un transporte caro desde el aeropuerto.
Además, con el poco tiempo que queda antes de su viaje previsto, es muy poco probable que encuentre vuelos baratos.

Vivo en Berlín y vengo de una zona del sur cercana a Frankfurt.

Además de las estupendas respuestas de Alexander y Willeke, yo añadiría lo siguiente:

1) Es factible ver sólo las atracciones principales, creo que pero será realmente difícil como todo el mundo mencionó, pero definitivamente factible. Yo hago turismo con algunos de mis visitantes en Berlín a pie o en bicicleta en alrededor de 6 horas y hemos cubierto la mayoría de las atracciones principales.

2) Yo sugeriría FRA->BER->MUC-FRA Además de la opción del autobús de Flix también consideraría BlaBlaCar. Que puede ahorrar mucho tiempo ya que es un coche compartido y por lo tanto mucho más rápido en la mayoría de los casos. Lo que te dará más tiempo en las ciudades. También me quedaría más tiempo en Berlín debido a los precios del Oktoberfest en Múnich en ese día.

3) Estos pases sólo existen para los trenes lentos y no para el ICE. Así que tendrías periodos de viaje mucho más largos y menos tiempo en un lugar.

Espero que BlaBlaCar te ayude y te ahorre tiempo de viaje para que puedas aprovecharlo al máximo.

Soy alemán y he vivido un tiempo en Múnich. Permítanme decir que no se puede ver mucho en dos días. En lugar de intentar hacer dos ciudades, ¿por qué no hacer sólo una bien? Múnich es más rica, más conservadora, con mucha cultura, una ciudad preciosa llena de lugares hermosos en el marco de los cercanos Alpes. Berlín es una ciudad joven e internacional con una mezcla variada de innovación, creatividad y lugares históricos (y un poco menos cara).