Mi país de origen afirma que tengo doble nacionalidad de otro país, el país en cuestión no. ¿Algún problema?

Me costaría mucho pensar en una situación en la que esto pudiera causar problemas. Tanto Bélgica como los Países Bajos son miembros de la UE y del espacio Schengen, por lo que parece válido suponer que para la mayoría de los países de fuera los requisitos de visado serían muy parecidos o idénticos.

Un número significativo de países no reconoce en absoluto la doble nacionalidad. Si no la reconocen, no la asumirán y no tendrán motivos para dudar de que tu declaración ("Soy ciudadano neerlandés") en su solicitud de visado sea incorrecta ni nada por el estilo.

Los que sí la reconocen probablemente también saben que el número de ciudadanos sin doble nacionalidad supera con creces al de ciudadanos con doble nacionalidad, por lo que tampoco tienen motivos para suponer que les ocultaste una segunda nacionalidad.

Otro punto relevante es que la mayoría de los países tienen una opinión neutral o amistosa de Bélgica y los Países Bajos. Mientras podría tener problemas en algunas partes del mundo si el país en el que presentas la solicitud supone que tienes doble nacionalidad israelí o siria, pero no creo que eso ocurra en Bélgica y los Países Bajos. (Aunque quizá en la República Democrática del Kongo, debido a su historia belga). Por tanto, la mayoría de los países ni siquiera se molestan en preguntar si alguien te considera su ciudadano.

Por último, creo que es más la excepción que la regla que un país coteje con el país que expide el pasaporte si el solicitante de visado tiene doble nacionalidad o no, sobre todo porque la mayoría de los países que permiten a sus ciudadanos tener doble nacionalidad de otro país ni siquiera se preocupan de si ese ciudadano tiene una segunda nacionalidad y no llevan esos registros. El caso que nos ocupa es el de la entrada eliminada en los archivos del registro neerlandés que usted ha mencionado.