¿Existe alguna regla general sobre los asientos más cómodos en un autobús de larga distancia?

Si el mareo es una consideración
Como niño que sufría de mareos, siempre intentaba sentarme entre las ruedas o por encima de ellas. En los autobuses modernos no se ven las ruedas, pero la zona entre ellas sigue siendo la que menos se balancea.

Vista frontal
Si quieres ver hacia adelante, el asiento delantero en el otro lado como el conductor es genial. En algunos autobuses habrá varios para elegir, ya que están en diferentes niveles.
Otra ventaja del asiento de la primera fila en muchos autocares (como menciona @nsn en su respuesta) es que no hay ninguna fila más adelante con asientos que se reclinan hacia tu cara. Una desventaja de los asientos delanteros, especialmente en países con muchos accidentes de tráfico, es que es más probable que sufras, (o mueras,) si el autobús choca con algo de frente.

Mi última excursión de varios días en "autobús" fue en uno de 20 plazas que se llenó con el número máximo de pasajeros, por lo que hubo que utilizar el asiento del "guía" junto al conductor. Me encantó, aunque tenía menos espacio para las piernas y no había lugar para guardar una maleta de mano. Las vistas eran increíbles.

Viajar en grupo
Pero para los que les gusta pasar el rato juntos mientras están en un autobús, el asiento trasero sigue ofreciendo las mejores opciones. Algunos autobuses (de los que han servido de autobús urbano en sus inicios) tienen conjuntos de asientos en los que dos se orientan hacia atrás, haciendo un grupo de cuatro para los amigos, sin tener que estar en la parte trasera del autobús.

Asiento de ventana o de pasillo
La vista a la izquierda o a la derecha marca la diferencia, pero a menos que sepa dónde estarán las mejores vistas, será una suposición.
Prefiero los asientos de pasillo, ya que con ellos tienes muy buenas vistas en un sentido y aceptables en el otro, mientras que los asientos de ventana dan buenas vistas en un sentido y casi nada en el otro.

Otras razones para elegir la ventanilla o el pasillo es el espacio que se obtiene y el hecho de que otros pasen.
Los que necesitan más espacio que la media, por razones de complexión, tamaño o porque estar metido en un espacio pequeño es incómodo, el asiento del pasillo es el preferido. Si necesita levantarse varias veces, ir al baño o simplemente estirar las piernas, el asiento del pasillo le resultará más fácil, sobre todo si se sienta junto a un desconocido o si su compañero de viaje suele dormir la mayor parte del tiempo.
Cuando se duerme, o se intenta hacerlo, en un autobús nocturno, el asiento de la ventanilla permite más posiciones para relajarse, incluida la de apoyarse en la ventanilla.
Si te sientas en el asiento de la ventanilla, es menos probable que te moleste la gente que pasa. Además, en un autobús/autocar donde no todo el mundo es de fiar, el asiento de la ventanilla también da menos acceso a tus cosas a la gente que pasa.
La contrapartida es que tienes menos acceso y menos control sobre los objetos almacenados en el techo.

Izquierda o derecha del autobús
Si quiere tener las mejores vistas por las ventanas laterales de un autobús, compruebe dónde estarán las mejores vistas.
Otras consideraciones son dónde estará el sol, ya que sentarse en el lado soleado en un día caluroso y mirar al resplandor durante la mayor parte del día será menos agradable. Esto es menos importante si el autobús tiene un revestimiento en las ventanas y si tiene un buen aire acondicionado.

No todos los autobuses se construyen igual, hay excepciones
Si existe la opción de reservar un asiento antes de subir al autobús, recuerde que no todos los autobuses son iguales. En algunos casos, el asiento del pasillo detrás del conductor es una buena opción, si puede ver hacia la parte delantera del autobús. En muchos autobuses la vista hacia la parte delantera está por encima del conductor y el espacio para los pies es agradable.
En algunos autobuses no tienes ninguna vista hacia delante y menos espacio para los pies.

Mi abuela tenía una rodilla que no podía doblar. Solicitaba el asiento junto a la salida de emergencia, ya que tenía espacio suficiente para sentarse. Pero en algunos casos el asiento no era adecuado y tenía que cambiar la solicitud al subir al autobús la primera vez. Viajó en autobús durante muchos años, con una empresa que hacía que la gente se moviera al siguiente asiento después de cada parada, de modo que todas las personas tenían los asientos mejores y peores. Ella se liberaba de ese movimiento, pero no siempre conseguía un buen asiento.

Autobuses de dos pisos, arriba o abajo
Si quiere que el autobús sea estable y no se balancee demasiado, el nivel superior del autobús de dos pisos no es bueno: los movimientos del autobús serán de 3 a 10 veces más fuertes en el piso superior.
Las personas que sufren mareos deben comprobar si se sienten bien en el piso superior de un autobús. No todos los enfermos deben evitar los pisos superiores, y los que sufren en algunos autobuses pueden sentirse bien en otros.

Las vistas son mejores, especialmente las de los asientos delanteros. Y a menudo hay dos juegos de asientos delanteros disponibles.

Consejos adicionales para los que sufren mareos
Vigila lo que comes y bebes antes y durante el viaje.
Evita los alimentos que te den ganas de eructar, comprueba si reaccionas mal con los alimentos grasos, los que te hacen tirarte pedos (también el día antes de un viaje) y otros alimentos que puedan alterar el sistema.
(No me lo creería, pero hay gente que afirma que tomar bebidas con gas para hacer eructar ayuda a no ponerse enfermo. Merece la pena probarlo si se sufre mucho).
Puede haber alimentos que te ayuden a combatir los ataques, como caramelos de menta o dulces hervidos que chupas. Habla con la gente de tu familia si hay más que también sufren la enfermedad, ya que seguro que hay historias de lo que ayuda y lo que hay que evitar.

Si hay una rejilla de ventilación para el aire acondicionado que puedas apuntar, hazla al menos en su nivel más bajo y dirigida justo delante de tu cara, a menos que la quieras más abierta y dirigida de otra manera, por supuesto. Si sólo hay salidas de aire fijas, puedes elegir tu asiento para tener una cerca, siempre que el aire que salga huela bien.
Además, los asientos situados detrás y debajo de la trampilla de evacuación, al abrirse, tendrán una calidad de aire mejor que la media del autobús.

Para los que sufrimos mal, con frecuencia o de forma violenta, advertir al conductor y pedirle que abra la puerta, cuando sea seguro hacerlo, a petición.
A veces una corriente de aire fresco calmará las ganas, en otras ocasiones poder apuntar fuera del autobús será mucho más fácil que usar una bolsa.
Y lleve siempre un recipiente adecuado para aceptar más de una vez que se enferme, o una serie de recipientes "lo suficientemente grandes". Lo mejor es que sean fáciles de cerrar con seguridad y lo suficientemente resistentes para soportar el líquido. Las bolsas de papel están bien siempre que puedas deshacerte de ellas poco después de usarlas. Las bolsas de plástico resistentes se conservan mucho más tiempo. Pero los olores que salgan no te ayudarán ni a ti ni a los demás, así que ciérralas y mantenlas cerradas a menos que sea necesario.

La mayoría de las personas que sufren mareos no pueden leer en un autobús, algunas excepciones pueden leer pero no pueden soportar estar aburridos. Así que hacer la prueba y puede resultar que se puede leer.
Lleva siempre algo que te quite el aburrimiento, como música o un libro hablado en los auriculares, o utiliza tu cerebro para distraerte, como soñar una historia o hacer las tablas de multiplicar.