Recientemente me aprobaron la Autorización Electrónica de Viaje (eTA) para viajar a Canadá por vía aérea. Una cosa que me preocupa es que una letra del alfabeto en mi número de pasaporte en el correo de aprobación de la eTA no está en mayúscula. ¿Debería volver a solicitar la eTA en este caso?
No, no tienes que volver a aplicar.
El caso de las letras en el número de pasaporte no importa.
Esto se desprende del estándar ICAO 9303-3 que tiene información sobre los caracteres utilizados en la Zona Legible por Máquina:
Los caracteres impresos están restringidos a los definidos en la Figura 4.
La Figura 4 no tiene letras mayúsculas y minúsculas separadas: 
Y el parte 4 del 9303 que habla sobre documentos de viaje exige que el número de pasaporte esté en la zona legible por máquina:
Entonces, si hubiera dos pasaportes con los mismos caracteres excepto uno en minúsculas y otro en mayúsculas, esto no sería discernible para ningún lector de máquinas, lo cual claramente es inaceptable. Tal vez has visto cuando el oficial de fronteras escanea tu pasaporte, ¡solo se desliza el borde inferior! Esa es la Zona Legible por Máquina. Aquí tienes un ejemplo: 
Estoy bastante seguro de que esto es correcto, pero sería una respuesta mucho mejor si pudieras encontrar una fuente.
@phoog curiosamente, el estándar no dice explícitamente esto para el número de pasaporte, pero todo en la MRZ es insensible a mayúsculas y minúsculas, por lo que el número de pasaporte también lo es. Añadido.
@chx el cálculo para el dígito de verificación también ignora mayúsculas y minúsculas; las letras de la A a la Z tienen los valores de 10 a 35, respectivamente.
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