No, está bien, suponiendo que todo lo demás está en orden y no estás tratando de (por ejemplo) evitar X-días-en-Y las restricciones por el cambio de pasaportes.
Para ampliar un poco más, las leyes de inmigración están diseñados para controlar el movimiento de personas, no de los pasaportes. Como usted como una persona siga todas las leyes aplicables, incluyendo declarando de otras nacionalidades y de las entradas anteriores cuando sea necesario, el uso de diferentes pasaportes para viajar no es un problema. Por supuesto, no pueden ser funcionarios de Inmigración que consideran que este sospechoso y puede hacer una pregunta o dos, pero esto solo no va a ser suficiente como motivo para denegar la entrada en cualquier país. (Contrariamente a la percepción común, la denegación de entrada a un país para una persona válida docs tiene que estar basado en el reglamento escrito, y generalmente requiere la aprobación de los supervisores, etc.)
Y por último, para aquellos que prefieren anecdata más lógica, yo soy un ciudadano dual y yo hemos entrado en una larga serie de países, incluyendo pero no limitado a los estados unidos, Canadá, Japón, Nueva Zelanda, Singapur, Tailandia y las Filipinas, con los pasaportes de mis dos nacionalidades. El único país que alguna vez incluso le preguntó acerca de esto fue el de Estados Unidos, y eso es porque he tenido ESTAs dos al mismo tiempo; cuando he dicho que he utilizado un pasaporte diferente que la última vez, se me concedió la entrada sin más preguntas.