He solicitado un permiso de trabajo durante mi estancia como estudiante. ¿Qué pasa si mi visa de estudiante es cancelada?

No sé sobre la ley checa, pero en muchos otros países:

Sólo porque tu trabajo no esté pagado no significa que no sea un trabajo.

En otras palabras, puede estar infringiendo la ley al hacer su pasantía no remunerada sin un permiso de trabajo. Le recomiendo encarecidamente que consulte con un abogado.

Para responder a su pregunta:

Sí, si su visado de estudiante se cancela antes de que se le conceda el permiso de trabajo (y no tiene otro permiso que le permita quedarse) entonces tiene que salir de la República Checa.

También debe ser consciente de que un cambio repentino de visado puede causarle problemas. Dependiendo de cuánto tiempo hayas estado estudiando, si de repente decides que no quieres estudiar, sino conseguir un trabajo, puede llevar a las autoridades checas a creer que realmente no tenías intención de estudiar, sino que tenías la intención de trabajar todo el tiempo. Esto puede llevarles a rechazar tu solicitud de permiso de trabajo.

Dependiendo del tiempo que le quede en su curso, podría considerar terminar sus estudios, hacer algún tipo de "entrenamiento" no remunerado en su empresa, y comenzar su trabajo cuando termine su curso.