Cuando uso pases de tren en Alemania, ¿puedo usarlos en trenes urbanos también? (U-bahn, S-bahn)

Es un poco más complicado de lo que ambas respuestas indican. Puedes usar trenes operados por "DB Bahn". Esto incluye la mayoría de los trenes de larga distancia, regionales y urbanos, pero no necesariamente todos ellos, ya que algunos trenes son operados por compañías privadas.

El pase también cubre la mayoría de las "S-Bahn" dentro de una ciudad pero, nuevamente, no todos. En particular, la S-Bahn en Berlín es operada por una compañía distinta bajo su propia marca y los pases de tren no son válidos en toda la red allí (pero para complicar las cosas aún más, todos los boletos de tren, incluidos los pases de tren, son válidos en la Stadtbahn donde los trenes regulares y la S-Bahn corren paralelos entre sí, ver esta publicación en raileurope.com).

Los trenes subterráneos llamados "U-Bahn" (por ejemplo, en Berlín o Munich) son operados por otras compañías y creo que no están cubiertos.

Nota que baso esto en el sitio web oficial y en mi conocimiento de la red ferroviaria alemana, pero nunca he usado un pase así. Nunca parecieron ofrecer un valor particularmente bueno para mí.

Sí, puedes viajar dentro de todas las ciudades alemanas siempre y cuando utilices los sistemas de transporte operados por la DB u otros incluidos en el Pase de Tren. (lista de servicios incluidos)

La mayoría de los autobuses, tranvías y metros no están cubiertos.

Tomado de ACPRail:

El Pase de Tren Alemán es válido en todos los trenes dentro de Alemania operados por Deutsche Bahn (DB). También puedes viajar a las estaciones fronterizas de Basel Badischer Bahnhof (Suiza) y Salzburgo (Austria). Los titulares de pase tienen acceso a trenes diurnos alemanes de alta velocidad y calidad como ICE, IC o EC, sin embargo se recomienda hacer reservas durante los períodos de mayor tráfico.* Excepción: pueden requerirse suplementos para los trenes ICE Sprinter.

Consulta ambos enlaces para obtener toda la información adicional que puedas necesitar.

En la lista de 2017 de empresas que participan en el German Rail Pass, S-Bahn Berlin GmbH se incluye como 'todas las líneas' en el área de validez del boleto.

Para los boletos normales de DB que solo contienen la palabra 'Berlín' (es decir, NO 'nombre de la estación de Berlín'), también son válidos para la S-Bahn dentro de la 'Ring-Bahn' que rodea el centro de la ciudad. Esto también se conoce como área de tarifa A.

La idea es que el traslado de una estación de tren a otra es parte de la tarifa.