Actualización 12/03/20: EE. UU. ahora está rechazando la entrada a cualquier persona que venga de Europa, durante 30 días. Así que ni siquiera llegarás a Atlanta.
Según el enlace a la embajada que proporcionaste, se te denegará la entrada a Jamaica. Esto probablemente ya haya sido ejecutado por el personal de KLM en Frankfurt. Esto significa que se te denegará el embarque en primer lugar.
La única excepción sería si eres (también) ciudadano jamaiquino. No mencionaste cuándo vuelas, así que si tu vuelo va a ser en unas pocas semanas o incluso días, la situación podría haber cambiado por completo. Entonces solo tendrías que esperar y seguir día a día para ver qué tiene que decir la embajada.
Según tu sugerencia de que aún podrías viajar solo a Atlanta, te sugiero que busques "omitir una escala de un viaje" aquí en este sitio. Esto generalmente termina mal (especialmente para un posible vuelo de regreso que será cancelado por la aerolínea). Dado que en EE. UU. siempre tienes que volver a revisar tus maletas en una conexión internacional, podrías al menos obtener tus maletas y, dado el Esta/Visa correcto para Estados Unidos, podrías salir del aeropuerto y esperar dos semanas allí. Dos semanas sería el período mínimo que tendrías que esperar antes de que te permitieran la entrada a Jamaica. Luego tendrías que comprar un nuevo boleto a Jamaica, por supuesto, y tu vuelo de regreso habría sido cancelado y tendrías que comprar ese también.
Con todo esto dicho, puede ser mejor llamar a la aerolínea (Delta en este caso, ya que reservaste con ellos) y ver si te pueden dar un reembolso (completo).