Cuando compras dos boletos separados, si pierdes tu conexión la aerolínea no te ayudará. Para ellos, el primer vuelo que llega tarde es como si tu coche se averiara de camino al aeropuerto, desafortunadamente, pero no tiene nada que ver con ellos. Cuando compras los boletos de conexión, una vez que te registras en el primer vuelo, eres de ellos y ellos te cuidarán.
Cambiar de avión en Frankfurt, especialmente de fuera de Schengen a Schengen, lleva mucho más tiempo que en muchos otros aeropuertos. (En realidad lo he añadido a la lista de aeropuertos en los que no haré una conexión.) Una hora es una conexión MUY estrecha en Frankfurt - lo he hecho y he tenido que rogar a la gente que me dejen saltar al frente de la línea etc, y casi pierdo mi avión. Hay aduanas, seguridad y mucho más. Una conexión de dos horas te daría suficiente tiempo en el aeropuerto siempre y cuando el primer vuelo no se retrasara. Con billetes separados probablemente sólo me sentiría seguro con una conexión de 4 horas.
Es posible que tenga que reclamar su equipaje por el control de aduana. Pregunte a su aerolínea.