"Borne libre service" significa que recogerás tu boleto en una máquina expendedora de boletos en Francia o Luxemburgo. (Quizás también en las estaciones de Eurostar, pero no estoy seguro si te permiten imprimir boletos que no son de Eurostar). Todas las estaciones principales de tren y la mayoría, si no todas, de las estaciones menores tienen una máquina expendedora de boletos, y también hay máquinas expendedoras en algunos centros comerciales. Necesitarás tener la tarjeta física francesa o internacional de crédito/débito con la que compraste el boleto (así que no tarjetas virtuales), la tarjeta debe tener un chip, y deberás ingresar el PIN para imprimir el boleto (ten cuidado si tu tarjeta vence entre el momento en que compras el boleto y el momento en que lo imprimes). También deberías llevar contigo la referencia de reserva de 6 letras, aunque creo que la máquina te permite imprimir todas las referencias de reserva que estén registradas en la tarjeta. Permítete unos minutos antes de que salga el tren (si hay una reserva, creo que debes imprimir el boleto al menos 15 minutos antes de que el tren salga, de lo contrario tu asiento podría ser reasignado a un pasajero de último minuto).
"Gare ou boutique" significa que recogerás tu boleto en una estación de tren o en una tienda de la SNCF en Francia. Esto debe ocurrir en horarios "razonables" y solo en estaciones o ciudades lo suficientemente grandes (no en aquellas que reciben 3 trenes al día). Una vez más, necesitarás tener la tarjeta física francesa o internacional de crédito/débito con la que compraste el boleto, y ser capaz de ingresar el PIN (pero la tarjeta no necesita tener un chip). También deberías llevar contigo la referencia de reserva de 6 letras, para identificar tu boleto en caso de problemas. No llegues en el último minuto, puede haber una larga cola en las ventanillas de boletos.
No sé por qué las dos posibilidades están separadas, no recordaba que fueran distintas y no veo qué procesamiento diferente harían. Podrás obtener tu boleto desde una ventanilla incluso si seleccionaste "Borne libre service", así que deberías elegir eso a menos que no tengas una tarjeta "chip-and-pin".