La entrada de Timtac es correcta y cubre la situación exacta que estás describiendo.
La entrada contiene el texto:
Esto no se aplica a los residentes de Japón con la Carta de Confirmación de Presentación de la Documentación Necesaria para la Reentrada a Japón, y un certificado médico con un resultado negativo de la prueba de Coronavirus (COVID-19). La prueba debe haber sido realizada como máximo 72 horas antes de la salida y el método de recolección de muestra debe ser 'hisopo nasofaríngeo' o 'saliva'.
La frase relevante aquí es "Carta de Confirmación de Presentación de la Documentación Necesaria para la Reentrada a Japón". Este es un documento emitido por un consulado japonés que permite a un pasajero que cumple con requisitos específicos ingresar al país. (Aunque dice "reentrada", hay múltiples referencias a que también se utiliza para la entrada inicial).
El documento al que has enlazado no es una lista definitiva de condiciones sobre quién puede ser autorizado a ingresar, de hecho, especifica que contiene "ejemplos específicos de casos donde la reentrada o la nueva entrada puede ser permitida dependiendo de la situación individual".
La palabra "puede" aquí es crítica ya que implica que se requiere verificación/admisión adicional basada en las condiciones. La Carta mencionada anteriormente es la prueba de esa verificación, y muestra que el gobierno japonés ha confirmado que el pasajero cumple con sus requisitos y tiene permiso para ingresar al país.
Incluso fuera de este ejemplo específico, el simple hecho es que Timatic nunca podrá cubrir cada situación. Siempre habrá casos excepcionales donde Timatic indique que un pasajero no puede viajar, pero si el pasajero puede proporcionar la documentación adecuada para confirmar que será admitido en el país extranjero (normalmente en forma de carta de aprobación del gobierno relevante), se le permitirá abordar. Situaciones como esta normalmente resultarán en retrasos en el check-in, por lo que siempre es una buena idea llegar temprano para permitir que se completen cualquier verificación adicional que la aerolínea desee realizar.
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No es un duplicado, que yo pueda ver ahora, pero estrechamente relacionado: travel.stackexchange.com/questions/158280/…