Sí, usted puede aplicar para una visa B1/B2 (o para el caso, cualquier otro tipo de visado), mientras que usted mantenga una ESTA. En general esto no sería necesaria como ESTA/PEV le da básicamente el mismo estatus de visa B1/B2, sin embargo la razón de que haya dicho que es una de las pocas diferencias - VWP sólo es válido durante 3 meses, mientras que un B1/B2 puede permitir que usted permanezca más tiempo (normalmente hasta 6 meses).
Dado que su ESTA fue aprobado a pesar de su arresto, y dado que no fueron condenados, es poco probable que el impacto que tendrán en su solicitud de Visa - sin embargo, usted tendrá que proporcionar los detalles de la detención, y es posible que su aplicación se retrasó como consecuencia de ello. Yo sugeriría tomar como prueba de su registro como sea posible, especialmente los documentos que demuestren la desestimación de los cargos.