Si tienes equipaje facturado, no hay duda, tendrás que pasar el control de pasaportes y necesitarás un visado para ello. Fin de la historia.
Si por cualquier otra razón tienes que pasar por el control de pasaportes, como por ejemplo si no puedes hacer la facturación móvil y necesitas llegar a un mostrador de facturación, lo mismo.
Si no lo haces, en teoría podrías hacer esa conexión sin visado. Salvo algunos casos de nacionalidades específicas en aeropuertos concretos que necesitan un visado de tránsito aeroportuario incluso en esta situación, a los países Schengen no les importa, siempre que tengas un vuelo de regreso confirmado bastante pronto (las normas publicadas en Timatic para los Países Bajos dicen "en el mismo avión o en la primera conexión disponible") y te quedes en la zona de operaciones (en la "zona internacional", lo que significa que no tienes que pasar por el control de pasaportes, lo que implica que no puedes reclamar y volver a facturar el equipaje). Si consigues llegar a Ámsterdam, nadie te impedirá hacer esa conexión.
El problema es que las compañías aéreas tienen la obligación, ante el país de destino, de transportar sólo a los pasajeros que cumplen las normas. Si un pasajero llega al control de pasaportes sin visado cuando lo necesita, la aerolínea recibirá una fuerte multa y tendrá que llevar al pasajero de vuelta.
Si la compañía aérea le ha vendido un vuelo de conexión, sabe que cumple las condiciones. Si alguna vez hay un problema con la conexión, tienen que ocuparse de ti (volver a reservar y demás), así que sigues cumpliendo las condiciones.
Pero si reservas dos billetes distintos, no tienen forma de estar seguros de que realmente tienes ese vuelo de continuación. Probablemente no puedan comprobar el estado de tu reserva (y no quieran hacerlo), ni siquiera si se trata de un billete real. Y lo que es más importante, si hay algún tipo de interrupción que le haga perder su vuelo en curso, las puertas del infierno se abren para usted y para ellos: la otra compañía aérea considerará que no te has presentado, cancelará tu billete, te verás obligado a comprar un nuevo billete a precios de última hora, en algunas rutas y a determinadas horas puede que no haya disponibilidad durante días, tienes muchas posibilidades de quedarte atrapado en el aeropuerto durante un tiempo o de llamar al control de pasaportes, te multarán, tendrán que llevarte de vuelta, intentarán cobrarte esa multa (sí, eso está en los términos y condiciones que aceptaste)
No quieren lidiar con eso. Te han vendido un billete para ir a Ámsterdam. ¿Puedes entrar en Holanda? Por favor, sube. ¿No puedes porque no tienes visado? Lo siento, no puedo dejarte embarcar.
A algunos agentes les convencerá una búsqueda en Timaric y cualquier prueba que tenga de su vuelo de regreso. La mayoría no lo hará. Las normas ya son lo suficientemente complejas cuando se trata de las conexiones que venden, así que no quieren correr ningún riesgo con las conexiones que no venden.
Cuando venden una conexión, tienen en cuenta los riesgos asociados (tener que volver a reservar, pagar hoteles y comidas si es necesario, etc.). Si no estás dispuesto a pagar el precio de esas garantías, ¿por qué deberían hacerlo ellos?
Algunas compañías aéreas pueden aceptar hacerlo. Ponte en contacto con la primera aerolínea y obtén una garantía por escrito de que te dejarán embarcar en esas condiciones (¡es muy probable que eso ocurra!). Si lo hacen, lleva una copia al aeropuerto, y buena suerte. Pero lo más probable es que no te garanticen nada, y entonces en el aeropuerto tienes muy pocas posibilidades de que te dejen embarcar.
En resumen: vuelva a reservar un billete sencillo o busque otro itinerario en el que pueda entrar en el país de conexión.