La respuesta puede variar en función de la aerolínea de que se trate, pero en mi experiencia de volar en clase Business en varias aerolíneas, tanto con billetes de pago como con billetes de premio o de categoría superior, diría que la experiencia es exactamente la misma.
Mi experiencia principal es en United Airlines. En este caso, las ventajas que recibes son exactamente las mismas en todos los casos, y no hay distinción entre los billetes. En el ejemplo concreto que mencionas de la selección de comidas, United da prioridad a la selección de comidas en función del estatus, y esto se aplica por igual a los pasajeros de premio, de clase superior y de pago. No recuerdo que ninguna otra aerolínea haya dicho que mi selección de comidas se vea afectada por el hecho de que mi billete sea de premio, de categoría superior o de pago.
La única diferencia que se me ocurre con United en concreto es que hace muchos años solían limitar el acceso a sus salas VIP Arrivals únicamente a los pasajeros de clase business "de pago", aunque incluso en este caso "de pago" incluía tanto a los pasajeros de pago como a los de premio, pero no a los pasajeros que habían sido ascendidos a clase business (aunque hubieran "pagado" por ese ascenso). Cambiaron esta política hace muchos años para permitir el acceso a todos los pasajeros de clase business, incluidos los billetes de categoría superior, y desde entonces han eliminado todas estas salas, por lo que ya no es relevante.
También he volado en clase preferente o de premio en muchas otras aerolíneas (Singapur, Thai, Eva, Air China, Qantas, Virgin Australia, ANA, Turkish, Lufthansa, American y Swiss, por nombrar algunas) y no recuerdo que me hayan limitado ninguna ventaja por estar en un billete de premio o de clase preferente.
En el caso concreto de las actualizaciones, puede haber diferencias en función del momento en que se produzca la actualización. Por ejemplo, si le suben de clase en la puerta de embarque, lo más probable es que no pueda utilizar las maletas facturadas gratuitas adicionales, la seguridad prioritaria y probablemente ni siquiera el acceso a la sala VIP, ya que cuando le suban de clase puede ser demasiado tarde para acceder a ella. En el caso de las aerolíneas que permiten pedir una comida específica con antelación, obviamente no podrá hacerlo si le suben de clase poco antes de embarcar en el vuelo.
Muchas aerolíneas aplican normas diferentes a los pasajeros "sin ingresos", pero este término no se refiere a los pasajeros de premio o de categoría superior, sino a personas como el personal de la aerolínea que viaja con billetes "gratuitos" (o, más normalmente, con grandes descuentos). En este caso, es muy común que se deniegue específicamente el acceso a las salas VIP, y la selección de comidas podría verse afectada (por ejemplo, los pasajeros no regulares tienen la prioridad más baja en United Airlines para la selección de comidas).
