He cruzado esa frontera en ambos sentidos.
Un caso especial que nadie ha citado es que hay otra vía estrecha que termina en Hendaya/Hendaia viniendo de San Sebastián/Donosti. En ella trabaja Euskotren, la compañía ferroviaria vasca. Esta línea permite cruzar la frontera en ambos sentidos.
La gente de la zona está acostumbrada a esta configuración. Como se ha citado, eso viene de un pacto del siglo XIX, las mentes eran muy diferentes a las de hoy en día (¡ojalá!). No recuerdo si es el mismo pacto que dicta que una isla en medio del río Bidasoa (que sirve de frontera entre España y Francia) pertenece seis meses al año a España y el resto del año a Francia.
Tenga en cuenta que antes del acuerdo de Schengen, había aduanas en cada estación. Tener aduanas españolas en el lado español de la frontera y viceversa tiene cierto sentido. Desde Schengen, no hay necesidad de aduanas, pero algunos controles aleatorios de la policía son habituales en cualquier frontera entre Francia y España. Así que algún tipo de problemas de jurisdicción puede explicar por qué esta configuración no ha cambiado.
Como comentario histórico, cuando España estaba bajo la dictadura de Franco pero se mantuvo de iure neutral en la Segunda Guerra Mundial, Franco fue recibido por Hitler en la estación de Hendaia. Si el encuentro hubiera tenido el anfitrión contrario en Irún, quizás los Aliados hubieran considerado a España como parte de las naciones del Eje.
Si accidentalmente te bajas antes de tiempo, tienes la línea de Euskotren como respaldo, o alternativamente puedes caminar la distancia entre las estaciones, que es un paseo de 30 minutos según Google Maps. Si eliges usar Euskotren, en Irún, la distancia entre las estaciones de vía ancha/estándar y de vía estrecha es de menos de 10 minutos andando. La estación de vía estrecha se llama "Irun Colón". En Hendaia las dos estaciones están una al lado de la otra.
En los otros puntos de paso a lo largo de los Pirineos hay que tener más cuidado, en Latour-de-Carol/La Tor de Querol la distancia entre los puestos fronterizos es un poco más larga, tal vez 5 kilómetros, y en Portbou hay una montaña que habría que subir y bajar para llegar al otro lado de la frontera (hay una carretera, no hace falta ir a pie). En el paso de Canfranc, el lado francés está comunicado por autobús.