Tengo malas noticias para ti: necesitarás una visa japonesa para esta conexión, y se te denegará el embarque si no tienes una.
No estoy seguro de cómo lograste reservar Cebu y ZipAir en el mismo itinerario, pero ambos son aerolíneas de bajo costo de punto a punto que no ofrecen conexiones con otras aerolíneas. Por lo tanto, deberás pasar por inmigración, recoger y volver a facturar tu equipaje, y pasar por inmigración nuevamente, y para los ciudadanos filipinos esto requiere una visa.
Además, Narita no es un aeropuerto las 24 horas, cierra por la noche y todos los pasajeros en tránsito son sacados afuera. Por lo tanto, si tienes una escala nocturna, necesitas una visa, punto final.
Los permisos de tierra están disponibles a discreción de los funcionarios de inmigración para los pasajeros que tienen un tránsito legal en el aire a través de los aeropuertos japoneses, y pueden completar su viaje incluso si se les niega el permiso de tierra. Desafortunadamente, tú no calificas.