TL;DR: No no lo hay.
JR es un grupo de empresas independientes que hacen un muy buen trabajo en el manejo de los trenes juntos, pero no colaboran realmente en la emisión de boletos y reservas, así que no hay un sistema centralizado de reserva de todo el JR .
Lo más cercano a esto es el JR East's Ekinet que permite reservar billetes más o menos en cualquier lugar del país, pero es sólo japonés, tiene un proceso de inscripción moderadamente complicado que requiere una tarjeta de crédito y una dirección japonesa, y sobre todo, requiere que cualquier boleto reservado sea físicamente recogido en las estaciones JR Este, es decir, en el área de Tokio y sólo en los puntos del norte. Si estás empezando tu viaje fuera de Tokio, como supongo que lo estás haciendo desde que preguntaste por JR Central y Oeste, que te den duro. Ahora Ekinet tiene un pequeña sección inglesa dirigido a los visitantes extranjeros, que tiene menos aros para saltar, pero sólo permite reservar los trenes JR East. Hasta donde sé, este es el único servicio en inglés disponible.
JR Central y West tienen una similar Expreso Yoyaku que cubre los Shinkansens de Tokaido y Sanyo. sólo (no hay trenes expresos no Shinkansen). Sin embargo, se aplican los mismos límites y cuesta 500/1000 yenes al año para arrancar. Además, tienes que elegir el servicio más caro si quieres reservar entradas para otras personas.
Por último, pero no menos importante, JR West, JR Kyushu y JR Shikoku operan otro servicio compartido con el pegadizo nombre de e5489 (lea ii goyoyaku o "buena reserva"), que permite reservar los Shinkansens de Sanyo y Kyushu, además de todos los servicios expresos en el área tri-JR. Y estoy seguro de que te sorprenderá saber que esto, también, requiere registrarse para ser miembro de la "Red J-WEST" en japonés con una dirección japonesa.
Todo lo dicho, Yo no me preocuparía demasiado . Puedes hacer reservas para cualquier tren JR en Japón fácilmente en persona en cualquier estación JR una vez que hayas aterrizado. Pero lo más importante es que las reservas sólo son necesarias en las épocas de mayor afluencia (Año Nuevo, Semana Dorada, Obon, tal vez los viernes por la noche para Tokio <->Osaka), el 99% de las veces se pueden conseguir asientos sin reservar o, para los trenes de reserva, reservar un asiento en el lugar.
