Volando a Alemania desde EE. UU. como ciudadano dual, ¿uso de pasaporte?

Creo que tienes los conceptos básicos correctos. En tu caso, ambos pasaportes podrían permitirte entrar en Alemania, pero Estados Unidos también tiene una regla que los ciudadanos estadounidenses deben usar su pasaporte estadounidense para ingresar al país (creo que los países europeos, incluida Alemania, no están muy preocupados por eso).

Dado que Estados Unidos utiliza los datos de las aerolíneas para reemplazar la inmigración de salida y verifica las listas de pasajeros (APIS) de las aeronaves entrantes, supongo que puede ser necesario usar tu pasaporte estadounidense para reservar el boleto para evitar problemas.

Siempre puedes mostrar ambos pasaportes al personal de la aerolínea (aunque es posible que ni siquiera te lo pidan ya que los ciudadanos estadounidenses no necesitan visa para ingresar a Alemania) y usar tu pasaporte alemán para el control de pasaportes alemán (aunque ni siquiera estoy seguro de que sea necesario usar el pasaporte local allí), incluso si el boleto fue reservado con el pasaporte estadounidense.

Finalmente, bajo la ley de la UE, los familiares (cónyuge y dependientes menores de 21 años) que no son ciudadanos de la UE solo deben someterse a un "control mínimo" (es decir, verificar la validez de sus documentos y establecer su identidad pero sin hacer preguntas sobre el propósito, medios financieros, etc. ver artículo 7 del Código de Fronteras de Schengen) y pueden usar el carril de ciudadanos de la UE/CEE (artículo 9) si están viajando contigo. Pero dado que estás viajando a tu país de ciudadanía (y no a otro país de la UE), no estás ejerciendo formalmente tus derechos de libre circulación dentro de la UE y las reglas podrían ser teóricamente diferentes.