Viajar de Canadá a Estambul y Atenas: ¿dos pasaportes diferentes?

Está completamente bien. Hago cosas similares todo el tiempo, aunque los dos pasaportes que tengo están exentos de visado en la mayoría de los lugares que visito.

Al funcionario griego no le importará si tiene un sello de Turquía en su pasaporte. Sólo le importarán los sellos de Grecia y de otros países del espacio Schengen, para determinar si alguna vez has sobrepasado tu visado. Suponiendo que no lo hayas hecho, no habrá ningún problema.

Por supuesto, si el funcionario griego hace preguntan sobre su viaje a Turquía, o si tiene la nacionalidad iraní, debe decirles que es de nacionalidad iraní, y si parece que quieren documentación al respecto, muestre su pasaporte.

En general, debe ofrecer la menor cantidad de información posible, pero siempre debe dar la información que le pidan.

Añadiré que una vez entré en Turquía con unos bosnios/canadienses con doble nacionalidad que no tenían sus pasaportes bosnios. Turquía es (o era entonces) uno de los pocos lugares a los que los bosnios pueden ir sin visado. Yo viajaba con un pasaporte estadounidense y la tasa de visado era de unos 15 o 20 dólares. Los canadienses, que entraban con su pasaporte canadiense, tenían que pagar una tasa de 60 dólares, si no recuerdo mal. Creo que los distintos importes de las tasas se basan en las tasas que tienen que pagar los turcos para visitar el país en cuestión.

Mis amigos lamentaron no haber traído sus pasaportes bosnios; te ahorrarás una buena cantidad si recuerdas el iraní.