¿Hay algún problema si se imprime primero el apellido que el nombre en un billete de avión?

Si te refieres a que "Ms Jane Doe" se convierta en "DOE/JANEMS" como la tarjeta de embarque de abajo, es completamente normal:

(cortesía Heb en Wikimedia Commons )

Como británica uso mi nombre de casada, pero en el continente se dirigen a mí por mi nombre de soltera o por ambos. Así que tengo un pasaporte con ambos nombres. Mi tarjeta de crédito tiene los dos nombres, pero en distinto orden. Así que a menudo acabo con billetes que tienen mis nombres en un orden diferente al de mi pasaporte. Esto nunca es un problema, ya que creo que las aerolíneas y la seguridad tienen que ser conscientes de que las convenciones varían, así que hay que aceptar los mismos nombres en diferente orden.