No debería haber ningún control sistemático en el aeropuerto para los vuelos entre París y Atenas. Esto significa que no te sellarán el pasaporte y que probablemente ni siquiera verás a ningún guardia de fronteras al ir o volver de París por aire (en cambio, ir por tierra a través de Serbia, Rumanía o Albania supondría salir y volver a entrar en el espacio Schengen, lo que tu visado puede permitir o no). Su estancia en Francia y Grecia formaría parte de una única estancia en el espacio Schengen, cubierta por su visado.
Más allá de eso, añadir un corto viaje de fin de semana a París en medio de un viaje a Grecia debería estar bien, pero solicitar un visado griego y entrar a través de Grecia cuando el objetivo principal de tu viaje es París (por ejemplo, pasar dos semanas en París con sólo un par de días en Grecia en cualquiera de los extremos del viaje para hacer la transferencia) sería un caso flagrante de fraude y te expondría a todo tipo de problemas (incluyendo ver tu visado anulado y tener que volver a tu país de residencia inmediatamente y probablemente tener grandes dificultades para conseguir otro visado Schengen en el futuro).
Aunque hayas cambiado honestamente de opinión después de obtener el visado, si pasas más tiempo en París que en Grecia, a un observador le parecerá que has mentido para entrar y que has elegido entrar y salir a través de Grecia para evitar que te detecten (en ese caso, si tu plan era ir a Francia durante mucho tiempo, se supone que debías solicitar el visado desde Francia, no desde Grecia). Por supuesto, como los pasaportes no siempre se comprueban, es posible salirse con la suya, pero planearlo desde el principio sería, no obstante, un abuso del sistema.
Ver también ¿Debo viajar por primera vez al país que me ha expedido el visado Schengen?