Obtener una visa de residencia prolongada de Alemania no te permitirá viajar por los otros países del espacio Schengen más de lo que te permitirían de otra manera. (Como eres australiano, no necesitas visa para estancias cortas; si tu nacionalidad requiriera visa, la visa de larga duración funcionaría efectivamente también como una visa de corta duración de entrada múltiple para los otros países del espacio Schengen durante su periodo de validez).
Sin embargo, una visa de residencia prolongada tiene como efecto que el tiempo que pases en el país que la emitió no se contará dentro del periodo de 90 de 180 días para estancias cortas en el espacio Schengen.
Por lo tanto, si obtienes una visa de vacaciones de trabajo, en realidad podrás viajar por el área Schengen durante 6 meses, pero debes distribuirlos de manera que cumplas con la regla de "como máximo, 90 días en cualquier periodo de 180 días". Por ejemplo, podrías empezar viajando durante 3 meses, luego quedarte en Alemania durante 4 meses, y después volver a viajar por 3 meses más.
Recuerda que debido a que no hay controles fronterizos internos, tu obligación de permanecer en Alemania durante los 4 meses intermedios es principalmente por el sistema de honor. Pero para minimizar el riesgo de problemas, sería prudente conservar cualquier documentación de tu presencia en Alemania durante ese periodo, como recibos de alojamiento o comprobantes de pago.
También recuerda que si deseas visitar algunos de los países de la UE fuera del espacio Schengen (como el Reino Unido o Irlanda), eso no se contará para la regla de 90/180 tampoco.